Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubash3bQ8BGG7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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