Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim6Q8BGE7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms