Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg4bQ8BGE6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atg4bQ8BGE6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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