Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms