Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ChfrQ810L3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms