Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms