Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec16aQ80U30 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms