Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lamp3Q7TST5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lamp3Q7TST5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms