Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dsg1bQ7TSF1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms