Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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