Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp3Q7TNH6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms