Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vma21Q78T54 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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