Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GypcQ78HU7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms