Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cspg5Q71M36 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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