Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynmQ70IV5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynmQ70IV5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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