Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv1Q704Y3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms