Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd300aQ6SJQ0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd300aQ6SJQ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms