Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tmeff1Q6PFE7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tmeff1Q6PFE7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tmeff1Q6PFE7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tmeff1Q6PFE7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tmeff1Q6PFE7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tmeff1Q6PFE7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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