Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtifQ6PEE2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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