Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms