Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smchd1Q6P5D8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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