Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms