Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt40Q6IFX3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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