Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TroQ6DIC6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms