Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms