Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Kiaa1549Q68FD9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Kiaa1549Q68FD9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms