Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ptpn13Q64512 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ptpn13Q64512 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ptpn13Q64512 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptpn13Q64512 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ptpn13Q64512 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms