Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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PtprdQ64487 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprdQ64487 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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