Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col4a5Q63ZW6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms