Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms