Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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