Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225 ms