Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd1Q61345 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Foxd1Q61345 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Foxd1Q61345 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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