Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cln3Q61124 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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