Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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