Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurod1Q60867 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms