Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc6a4Q60857 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms