Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppp1r1bQ60829 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp1r1bQ60829 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms