Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot7Q60809 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot7Q60809 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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