Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atf3Q60765 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms