Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samhd1Q60710 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samhd1Q60710 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms