Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Trappc1Q5NCF2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Trappc1Q5NCF2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Trappc1Q5NCF2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Trappc1Q5NCF2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Trappc1Q5NCF2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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