Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fam208bQ5DTT3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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