Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urb1Q571H0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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