Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Spsb3Q571F5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms