Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms