Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc3lQ4KL14 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms