Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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