Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms