Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc110Q3V125 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms